大蒜含有豐富的營養物質，尤其是具有獨特生物活性的大蒜素，對各種細菌、病毒具有強大的抑制和殺滅作用，可用於急慢性腹瀉、咽喉炎、感冒咳嗽、慢性胃炎、胃潰瘍的防治，食用大蒜還對中老年人的心腦血管健康大有裨益。

 
大蒜既可調味，又能防病健身可謂「天然的抗生素」。以前沒有抗生素時，要是傷口長了膿皰癤子，老人家都會將蒜瓣搗爛，敷在患處以盡消毒殺菌之效。現代藥理研究發現，大蒜的殺菌功效在於「大蒜素」，它對多種球菌、桿菌、真菌和病毒等均有抑制和殺滅作用，所以被視認為是天然的盤尼西林（青黴素）、天然廣譜抗生素。
要發揮大蒜的抗菌效果，盡可能使用生大蒜，而不非煮熟的大蒜。因為大蒜素對溫度很敏感，溫度越高大蒜素分解得越快。有研究發現，大蒜提取液放在0度Ｃ的環境下，裡面的大蒜素會很穩定。連放五天後再測量，大蒜素的含量幾乎沒有明顯下降。但是倘若放在五十度Ｃ的環境下，大蒜素在隔日就幾盡消失。可想而知，只要將大蒜通過加熱，裡面的大蒜素就會被破壞，抗菌殺毒的效果就會減弱。
病毒性的腹瀉，可以試著食用生大蒜的方法來治療。但有個地方需注意，腹瀉時不建議只吃生大蒜，因為此時腸道較敏感，大蒜帶有一定的刺激性，單吃的話，反而會刺激腸道分泌更多液體，加重腹瀉。若配上米粥來吃，就可消除這個副作用。