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《四庫全書》中「四庫」即「四部」，即指《四庫全書》是以經史子集為其分類方式，共四十四類六十六子目。約略的分類方式如下：

經部：易、詩、書、禮、春秋、孝經、五經、四書、樂、小學。

史部：正史、編年、記事本末、別史、雜史、詔令奏議、傳記、史鈔、載記、時令、地理、職官、政書、目錄、史評。

子部：儒家、兵家、法家、農家、醫家、天文算法、術數、藝術、譜錄、雜家、類書、小說、釋家、道家。

集部：楚辭、別集、總集、詩文評、詞曲。