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胞內進行的呼吸作用可分為三部份：

（1）把葡萄糖打開成兩個三碳分子—丙酮酸，兩個ATP和兩個NADH2，這部分稱為糖解作用（glycolysis），是在細胞質內進行的。如果是澱粉，得先由酵素分解成葡萄糖，而其他醣類可先轉變成葡萄糖，才得進行糖解作用，這就是為什麼在醫療時常注射葡萄糖液，來補充病人體力（圖2-12）。

（2）糖解作用所產生的丙酮酸進入細胞中稱為粒線體的小房間內（胞器），進行一連串的反應，我們稱為三碳酸循環（tricarboxylic acid cycle），三個碳的丙酮酸陸續放出三個二氧化碳，同時產生四個NADH2，一個FADH2，一個GTP（圖2-13）。

（3）最後一部份我們稱為電子運輸系統（electron transport system）是由一連串的的反應組成，包括NADH2和FADH2，是在粒線體的壁上，當NADH2和FADH2，從糖解作用和三碳循環送到電子運輸系統後，電子和氫便依照能量位階的高低一級一級地滾了下來，最後和氧氣合成水，滾下來的當中，所帶的能量便轉到生成ATP上（圖2-14）。

以上因為需用氧氣，我們稱為有氧呼吸（aerobic respiration）。如果氧氣缺乏呢？如我們激烈運動後，來不及補充氧氣，便會抑制糖解後的運作，直接將糖解作用的丙酮酸還原成乳酸（圖2-15），故常有肌肉酸痛感覺。酵母菌在釀酒時變成酒精和二氧化碳，我們稱之為發酵（fermentation），亦是同樣的道理。一些乳酸細菌和乳酸酵母等在少氧狀態下可形成乳酸，應用在酸乳發酵和醃菜工業上（圖2-16）。還有一些行無氧呼吸（anaerobic respiration）的細菌，最後接受電子和氫的不是氧氣而是其他物質，如硫便因此而產生惡臭的硫化氫。

記得，如果罐頭漲了起來，千萬不要吃，即很可能是消毒不完全，裡而長了能產生有毒物質的無氧呼吸細菌--肉毒桿菌。

我們知道細菌並沒有如粒線體等小器官，他們的呼吸作用在細胞質和膜上進行。

http://microbiology.scu.edu.tw/MIB/lifescience/wong2/ch02-3.htm