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上胚軸（epicotyl）

種子萌芽時，位於子葉之上的莖，稱為上胚軸。蠶豆與豌豆的種子萌發時，幼苗只長出上胚軸，而子葉則是留在土壤中，並不出土。

下胚軸（hypocotyl）

種子萌芽時，位於子葉之下的莖，稱為下胚軸。菜豆的種子萌發後，幼苗的下胚軸彎曲成弓狀；下胚軸生長時，順勢將子葉頂出土壤，隨後下胚軸伸直，初生葉展開，以進行光合作用；子葉則逐漸萎縮而掉落。

胚軸出土

菜豆的下胚軸會變成鉤狀，將子葉推出地面；經過光照刺激後，下胚軸逐漸變直。蠶豆和豌豆的上胚軸出土，子葉留在土壤中。

芽鞘（coleoptile）

禾草與玉米等單子葉種子萌發時，包覆在胚芽外面的構造稱為芽鞘。在胚芽逐漸伸長鑽出土壤時，芽鞘可以保護幼嫩的胚芽。芽鞘突出地表後，芽鞘停止生長，幼葉則快速生長、突破芽鞘、開始進行光合作用。