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奠基者效應（英語：founder effect，亦稱為建立者效應或創始者效應、始祖效應）是加速族群遺傳漂變作用的一種形式，指由帶有親代群體中部分等位基因的少數個體重新建立新的群體，這個群體後來的數量雖然會增加，但因未與其他生物群體交配繁殖，彼此之間基因的差異性甚小。這種情形一般發生於對外隔絕的海島，或較為封閉的新開闢村落等。