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正確答案是 (D) SMTP。

SMTP (Simple Mail Transfer Protocol) 是電子郵件在電子郵件伺服器之間交換訊息時所應用的協定。它是一種用於傳送、接收和轉發電子郵件的標準協定。SMTP 定義了一套規則和指南，以確保郵件可以從寄件人的郵件伺服器成功地傳遞到收件人的郵件伺服器。

當寄件人使用電子郵件客戶端（例如 Gmail、Outlook 等）發送一封郵件時，該郵件會透過 SMTP 協定被發送到寄件人的郵件伺服器。然後，郵件伺服器使用 SMTP 協定將郵件轉發到收件人的郵件伺服器。收件人可以使用 POP3（選項 C）或 IMAP（Internet Message Access Protocol）協定來從自己的郵件伺服器中接收郵件。

DNS（Domain Name System，選項 A）是另一種協定，用於將域名解析為 IP 地址，以便在互聯網上找到相應的服務器。FTP（File Transfer Protocol，選項 B）則是用於在網路上傳輸檔案的協定，與電子郵件的傳送和接收無關。

因此，當在郵件伺服器之間交換電子郵件訊息時，使用的協定是 SMTP（選項 D）。

選項 C 中的 POP3（Post Office Protocol version 3）協定是用於電子郵件客戶端（如Outlook、Thunderbird等）從郵件伺服器上下載郵件的協定，而不是用於郵件伺服器之間交換訊息。

當用戶使用電子郵件客戶端設定 POP3 協定時，客戶端會連接到郵件伺服器並下載新的郵件到本地設備。一旦電子郵件被下載，通常在郵件伺服器上就不再保留這些郵件的副本，除非用戶設定為保留副本。POP3 協定僅允許單向的郵件下載，而不是用於郵件伺服器之間的互相傳送。

在電子郵件的傳送過程中，當郵件從一個郵件伺服器傳送到另一個郵件伺服器時，使用的是 SMTP（Simple Mail Transfer Protocol）協定。因此，選項 C 中的 POP3 協定並不正確，因為它與郵件伺服器之間的訊息交換無關。