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腦中最常見的神經傳遞物包括乙醯膽鹼、GABA、血清素、多巴胺、正腎上腺素、腎上腺素、褪黑激素、腦內啡等。

(A) 乙醯膽鹼(Acetylcholine) --是運動終板的神經傳遞物，箭毒的致癱瘓效果就是來自阻斷此突觸的神經傳遞物。 乙醯膽鹼在腦神經中也作為神經傳遞物，具有特異的乙醯膽鹼受體，包括菸鹼型乙醯膽鹼受體、蕈毒鹼型乙醯膽鹼受體。

(B) 甘胺酸(Glycine) 
(C) γ-胺基丁酸(gamma-aminobutyric acid ,GABA) --是許多鎮靜藥物調節的基礎。
(D) 麩胺酸(Glutamate) --在突觸的量的不同形成的突觸可塑性被認為是構成記憶和學習的重要神經化學基礎。過量的麩胺酸會導致興奮毒性，引起靶細胞死亡。
(E) 多巴胺(Dopamine) --在腦中有多種重要功能。包括運動行為的調節，動機與情緒激發相關的快感，在獎賞系統中的重要角色。帕金森病與多巴胺不足有關；精神分裂症與較高水平的多巴胺有關。

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