學習重點 膠原蛋白的脯胺酸經羥化形成羥基脯胺酸:有助於穩定三股螺旋,維持膠原蛋白的結構與機械性質。 常見磷酸化位點為絲胺酸、蘇胺酸及酪胺酸:三者側鏈都有羥基;苯丙胺酸缺少側鏈羥基,不是一般蛋白激酶的典型作用位點。 醣基化先辨認 N-連結與 O-連結:N-連結主要接在天門冬醯胺的側鏈醯胺氮;O-連結主要接在絲胺酸或蘇胺酸的側鏈羥基氧。 凝血酶原含有 γ-羧基麩胺酸:由麩胺酸經維生素 K 依賴性 γ-羧化形成,有助於鈣離子結合及凝血功能。 核心觀念 一、轉譯後修飾:看殘基、反應與功能 蛋白質合成過程中或合成後,可經由酵素在特定胺基酸殘基上進行化學修飾,影響蛋白質的構形、活性、穩定性或分子間作用。常見類型包括磷酸化、醣基化、羥化與羧化。作答時應將「哪一種胺基酸」、「加上什麼基團」與「產生什麼功能」一起記憶。 修飾本單元的重要位點主要意義 磷酸化Ser、Thr、Tyr調節蛋白質及酵素功能 N-連結醣基化Asn醣基與側鏈醯胺氮形成共價鍵 O-連結醣基化主要為 Ser、Thr醣基與側鏈羥基氧形成共價鍵 羥化膠原蛋白中的 Pro形成羥基脯胺酸,穩定三股螺旋 γ-羧化凝血酶原中的 Glu形成 γ-羧基麩胺酸,促進鈣離子結合 二、膠原蛋白:脯胺酸羥化 膠原蛋白合成時,肽鏈上的特定脯胺酸(proline,Pro)殘基會經脯胺酸羥化酶作用,形成4-羥基脯胺酸(4-hydroxyproline)。反應是在殘基上增加羥基(–OH),因此稱為羥化。 此反應需要氧、鐵離子及 α-酮戊二酸,並依賴維生素 C維持酵素中鐵離子的適當狀態。羥基脯胺酸有助於穩定膠原蛋白的三股螺旋,影響其結構穩定性與機械性質。遇到脯胺酸修飾與膠原蛋白「結構彈性」相關的敘述,應連結到羥化;膠原蛋白的主要力學功能則是提供抗拉強度。 膠原蛋白中的部分離胺酸(Lys)也會羥化,形成羥基離胺酸,可進一步接受醣基化,並與膠原蛋白交聯的形成有關。脯胺酸羥化與離胺酸羥化都不是羧化。維生素 C 缺乏會使膠原蛋白形成受影響,可造成牙齦出血、組織脆弱及傷口癒合不良。 三、磷酸化:絲、蘇、酪具有側鏈羥基 蛋白激酶可將 ATP 的磷酸基團轉移到蛋白質殘基上;蛋白磷酸酶則可移除磷酸基團,因此磷酸化通常是可逆性調節。加入磷酸基團會改變局部電荷、構形或蛋白質間作用,可能使酵素活化,也可能使酵素受到抑制,不能一律判定為活化。 胺基酸側鏈特徵一般磷酸化判斷 絲胺酸(Ser)具有醇類羥基常見位點 蘇胺酸(Thr)具有醇類羥基常見位點 酪胺酸(Tyr)芳香環上具有酚羥基常見位點 苯丙胺酸(Phe)具有苯環,但沒有側鏈羥基不是典型位點 酪胺酸與苯丙胺酸的差別在於側鏈是否有羥基,不能因為兩者都有芳香環就視為相同。比較這四種胺基酸何者最不容易被磷酸化時,判斷重點是苯丙胺酸缺少側鏈羥基。蛋白質磷酸化仍有其他特殊位點,不宜將所有生物體的磷酸化絕對限定於 Ser、Thr、Tyr。 四、醣基化:N 接 Asn,O 接 Ser、Thr 醣蛋白的醣基化是酵素將醣基連接到蛋白質上的過程。最重要的兩類為N-連結與 O-連結,名稱中的 N 與 O 指的是蛋白質端參與鍵結的氮原子或氧原子。 類型主要胺基酸連接位置與鍵結 N-連結醣基化天門冬醯胺(asparagine,Asn)側鏈醯胺氮,形成 N-糖苷鍵 O-連結醣基化絲胺酸(Ser)、蘇胺酸(Thr)側鏈羥基氧,形成 O-糖苷鍵 N-連結醣基化常見的辨識序列為Asn-X-Ser/Thr,X 不為脯胺酸;但具有此序列不代表一定發生醣基化。Asn 是天門冬醯胺,不可與天門冬胺酸(aspartate,Asp)混淆,醣基接的是側鏈醯胺氮。 一般醣蛋白常見的醣基化位點為Asn、Ser、Thr。半胱胺酸(Cys)與色胺酸(Trp)不是典型 N-或 O-連結醣基化的主要位點,因此在比較「最不容易」或「主要位點除外」時,應優先排除它們。特殊的 S-連結或 C-連結醣基化確實存在,故「不是主要位點」不等於「任何情況下都不能醣基化」。 酪胺酸雖可在特殊情況下形成 O-連結醣基化,但一般醣蛋白最典型的配對仍是Asn-N-糖苷鍵、Ser/Thr-O-糖苷鍵。此外,酵素性醣基化(glycosylation)應與非酵素性糖化(glycation)區分,不可因離胺酸可參與非酵素性糖化,就將它列為典型 O-連結醣基化位點。 五、凝血酶原:維生素 K 與 γ-羧基麩胺酸 凝血酶原的特定麩胺酸(Glu)殘基經維生素 K 依賴性 γ-羧化,形成γ-羧基麩胺酸(γ-carboxyglutamate,Gla)。增加的羧基有助於結合鈣離子,使凝血蛋白能有效與帶負電的膜磷脂作用,參與凝血反應。 辨識特徵性修飾時,應記住膠原蛋白對應羥基脯胺酸,凝血酶原對應 γ-羧基麩胺酸。甲基離胺酸屬於離胺酸甲基化的產物;硒半胱胺酸則藉特殊轉譯機制納入蛋白質,都不是凝血酶原此項維生素 K 依賴性修飾的產物。 常考陷阱 將羥化寫成羧化:羥化增加 –OH;羧化增加 –COOH。脯胺酸形成的是「羥基脯胺酸」,凝血酶原的麩胺酸形成的是「γ-羧基麩胺酸」。 將 Ser 寫成 N-連結位點:Ser、Thr 主要以羥基氧形成 O-連結;Asn 才是典型 N-連結位點。 把 Asn 與 Asp 混為一談:典型 N-連結醣基化要認天門冬醯胺及其側鏈醯胺氮。 認為有芳香環就能磷酸化:Tyr 有酚羥基,Phe 沒有;一般比較時,Phe 最不容易被磷酸化。 將 Cys、Trp 列為主要醣基化位點:一般考點以 Asn、Ser、Thr 為主,特殊醣基化不改變這項判斷。 認為磷酸化一定活化酵素:作用取決於蛋白質與修飾位置,可能活化,也可能抑制。 混淆維生素 C 與 K:維生素 C 協助膠原蛋白羥化;維生素 K 參與凝血蛋白的 γ-羧化。 記憶口訣 「磷找絲蘇酪;N 糖天門冬醯胺,O 糖絲與蘇;C 助脯羥膠原穩,K 助麩羧結合鈣。」 「脯羥」指脯胺酸羥化;「麩羧」指麩胺酸 γ-羧化。先分清羥與羧、氮與氧,即可掌握本單元的主要判斷。