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長濱文化：舊石器時代，東部海岸及恆春半島一帶，其石器特徵可能和中國大陸南部史前文化有關聯。

大坌坑文化：新石器時代早期，它是適應濕暖的海洋、河口和河湖等自然環境的一種文化。（北部淡水河口、西南部沿海地帶）

圓山文化：新石器時代晚期，位於北部，圓山遺址發現帶孔的人牙飾品，顯示出可能發生過爭奪資源的戰爭。

十三行文化：金屬器時代，位於北部，出現來自東南亞、中國大陸的器物，十三行文化的主人可能是凱達格蘭族的祖先。