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蟲體主要寄生於鮭科魚類（如河鱒，brook trout，Savelinus fontinalis）腸道上皮細胞，有時亦會造成系統性疾病，而發現蟲體存在於腎、脾及肝實質組織之血管內。目前依文獻記載另有三種旋核六鞭毛蟲；1.感染大西洋鮭魚（Atlantic salmon, salmo salar L）、北極紅點鮭（Arctic char, Salvelinus alpinus）、河鮭（chinook satmon, Oncorhynchus tshawytscha）、鮰魚（grayling, Thymallus thymallus）之Spironucleus barkhans（Spironucleus salmonicida, R）。2.感染多種鮭科魚類及淡水養殖魚類（包括鯉科、慈鯛科）、淡水與海水觀賞魚類之扭轉旋核六鞭毛蟲（Spironucleus vortens）。3.感染大西洋鱈魚（Atlantic cod, Gadus morhua L.）...

蟲體主要寄生於鮭科魚類（如河鱒，brook trout，Savelinus fontinalis）腸道上皮細胞，有時亦會造成系統性疾病，而發現蟲體存在於腎、脾及肝實質組織之血管內。目前依文獻記載另有三種旋核六鞭毛蟲；1.感染大西洋鮭魚（Atlantic salmon, salmo salar L）、北極紅點鮭（Arctic char, Salvelinus alpinus）、河鮭（chinook satmon, Oncorhynchus tshawytscha）、鮰魚（grayling, Thymallus thymallus）之Spironucleus barkhans（Spironucleus salmonicida, R）。2.感染多種鮭科魚類及淡水養殖魚類（包括鯉科、慈鯛科）、淡水與海水觀賞魚類之扭轉旋核六鞭毛蟲（Spironucleus vortens）。3.感染大西洋鱈魚（Atlantic cod, Gadus morhua L.）、haddock（Melanogrammus aeglefinus L.）、burbot（Lota lota, Gadidae）、saithe（Pollachius virens L.）之突瘤旋核六鞭蟲（Spironucleus torosa）。

目前依文獻記載寄生於魚類（包括養殖或野生）之六鞭毛蟲（包括旋核六鞭毛蟲約有30種，R）。一般認為寄生於魚類之旋核六鞭毛（Spironucleus spp.）只有一個宿主，直接傳播。滋養體（trophozoites）在魚腸道中以縱二分裂之方式繁殖，亦可寄生於胃、幽門盲囊、肝、膽囊、血液和膀胱等，且可隨糞便排入水中，魚通過吞食滋養體，通過前，中到達後腸生長、繁殖；同時滋養體在魚腸道中能形成胞囊（cyst），也可經過胞囊進行傳播。Uzmann及Ayduk（1963, R）在厭氧條件下能培養獲得鮭六鞭毛蟲（鮭旋核六鞭毛蟲，H.＝S. salmonis）；旋核六鞭毛蟲是導致許多北美、歐洲、亞洲鮭科魚類養殖場嚴重損失的重大病因之一；Fard等氏（2007）報告旋核六鞭毛蟲感染虹鱒（rainbow trout, Oncorhynchus mykiss）體長10至20公分最常寄生於幽門區，其中消化道PH值為6.8～7.9，平均值為7.3，同時認為旋核六鞭毛蟲在體內消化道最適生長之PH值為7.1～7.5。至近年來的推論，因為在正常養殖鮭科魚類腸道中，常能檢查出少許之鞭毛蟲；所以認為旋核六鞭毛蟲對魚類之侵害證據還不充足，一般皆認為無害或是魚體發病的誘因(個人認為可能是營養不良導致蟲體大量繁殖造成危害)；據大陸學者汪建國在稻田和池塘養殖草魚之腸道中發現中華六鞭毛蟲（Hexamita sinensis, 1956）的數量遠超過其他種類之原生動物，而且越到後腸其蟲體數量愈多，尤其是在成網狀未消化的殘渣物中數量更大；但對魚體卻無致病性；由此推論，可能符合凡是吃食植物為生的動物大多數具有許多原生動物在它們的消化道中，所以可能與消化植物纖維有關，可以進一步的推論，中華六鞭毛蟲生活於草魚腸道中似乎是屬於共生現象。

本病原屬雙滴蟲目鞭毛蟲，可能由原始的Enteromonas自我複製、不完全分裂演化而來，並且Brugeroolle等氏（1974、1975、1979）假設雙滴目的進化途徑為：Trepomonas─Hexamita─Spironucleus─Octomitus─Giarda。六鞭毛蟲之蟲體兩個對稱核與兩條後鞭毛著生面成一定角度；不同種類、角度可能不一樣、角度的變化或許能夠反映六鞭毛蟲科內的種系進化趨勢（R），由電子顯微鏡行形態學觀察蟲體表桿狀體的存在否、體內是否見到粗糙型內質網，一般體表無桿狀體之蟲體、其體內含有豐富粗糙型內質網，並間接推論體表無桿狀體之蟲體合成蛋白多肽的功能旺盛，是否具蟲體分類之依據；同時依細胞骨架、微小管、細胞質呈貌等超顯微構造分類屬別，並由不同蟲體株SSU rRNA基因序列分析比較，致病株與非致病株間是否具某基因序列的變異或缺損，並發展出快速檢查、鑑別的方法，是目前在臨床診療上極需解決的問題。

目前使用藥物治療罹病魚群，特別是食用魚類限於行政院農業委會動植物防疫檢疫局頒布的水產動物用藥使用規範裏所登錄的藥物方可使用，間牽涉的藥物停留期，需確實執行，以避免傷害廣大的消費者之身體健康。