複音音樂擁有漫長的歷史,在中世紀的教會聖詠中,就有了最早的複音音樂,僧侶們在唱頌歌的時候各自在不同的聲部上吟唱不同的旋律。其後尼德蘭的荷蘭樂派進一步發展出複音的理論和寫作技術。當中的作曲家杜飛(Guillaume Dufay,1400-1474)在創立了「四部和聲」的寫作技巧。為後來的對位法理論開闢出完善的道路。
複音音樂發展的黃金時期是巴洛克時期,巴赫被認為是該時期作曲家的主要代表,因為他的對位音樂已達複音音樂的頂峰。
隨著主音音樂在17-18世紀的發展,純粹的複音音樂漸漸地被大眾遺忘,但是複音概念和創作手法仍一代代地繼承了下來。複音理論也仍然是音樂創作中重要的學科之一。