因為缺碘而甲狀腺素分泌不足，所引發的症狀稱為 iodine deficiency disorders (IDD)，包括心智障礙、甲狀腺機能不足、甲狀腺腫大、克汀症 (cretinism)、以及程度不等的生長與發育異常。
還可導致孕婦流產、死產、嬰兒先天畸形、新生兒死亡率增高，兒童、青少年體格發育落後，成人甲狀腺功能低下導致的學習能力、工作能力、創造能力的下降等一系列人體不同時期的健康損害，嚴重缺碘還會造成聾、啞、呆、傻、發育遲緩和運動障礙等疾病。
缺碘對腦部發育的傷害最為嚴重，可導致智商明顯低落，因為胎兒與新生兒時期神經組織髓鞘化作用最活躍，並且受甲狀腺素控制。
胎兒甲狀腺機能不足會嚴重地傷害神經系統，最嚴重的後果就是短小性癡呆症(克汀症)，伴有嚴重智障、體型矮小、聾啞症、痙攣等缺陷。
 
缺碘初期的臨床症狀是甲狀腺體積增大，這是對缺碘補償反應，可用觸診或超音波掃描法診斷。