複選題

12. 2024 年諾貝爾化學獎授予了大衛·貝克(David Baker)、德米斯·哈薩比斯(Demis Hassabis)與約翰·瓊珀(John M. Jumper)，表彰其在蛋白質科學領域的革命性貢獻。大衛·貝克成功利用運算方法實現了「蛋白質設計」，能從無到有構建自然界不存在的全新蛋白質結構；哈薩比斯與瓊珀則透過 Google DeepMind 開發的人工智慧模型 AlphaFold 2，解決了困擾生物化學界長達 50 年的「蛋白質摺疊 問題」。這項成就結合了深度學習與結構生物學，預測出幾乎所有已知蛋白質的三維結構，不僅極大地加速了藥物研發與催化劑設 計，更標誌著計算化學與 AI 正式進入生命科學的核心殿堂，開啟了「數位生物學」的新紀元。下列關於「計算科學」與「實驗科 學」之相關敘述，哪些正確？
(A) 哈薩比斯與瓊珀開發的 AlphaFold 2 利用了深度神經網絡(Transformer 架構)，能僅憑胺基酸序列精準預測蛋白質的三維空間 結構，其預測精度在蛋白質結構預測關鍵評估(Critical Assessment of protein Structure Prediction, CASP)競賽中已達到與實驗觀測 (如 X 射線晶體繞射)相近的水準
(B) 2024 年是諾貝爾獎歷史上首次將化學獎授予人工智慧相關研究，並創下了同一年度中 AI 相關貢獻同時獲得物理學獎、化學獎 以及生理醫學獎這三項科學獎項的歷史紀錄
(C) 蛋白質摺疊問題的核心在於「列文索弔詭」(Levinthal's paradox)，AlphaFold 2 的成功證明了蛋白質分子在摺疊過程中會透過遍 歷(Exhaustive search)所有可能的構型，從而找到能量最低的穩定態
(D) 大衛·貝克教授開發的 Rosetta 運算工具，其核心突破在於實現了蛋白質的「從頭設計」(De novo design)，讓科學家能根據特定 的功能需求，設計出自然界演化過程中從未出現過的全新蛋白質
(E) 由於 AlphaFold 2 能精準預測結構，科學界公認此成就已徹底推翻了克里斯蒂安·安芬森(Christian Anfinsen)在 1970 年代提出的「蛋白質序列決定其三維結構」之熱力學假設