NGS 的基本概念就是將核酸片段化後同時進行大規模的定序分析，實驗目的不外乎為了找已知或未知的序列資訊，找已知的前提就是該實驗樣品之物種必須有參考序列 (Reference Sequence)，根據其相似度進行比對(Mapping) 及記數 (Counting) 的分析，若今天該物種無參考序列，就必須透過組裝 (Assembling) 的方式，進一步預測與驗證就可以獲得序列資訊。
在處理最微量、最脆弱、和高度混合的法醫調查檢體，FGx都能有效應用次世代定序(NGS)高正確性、高解析度的特點來提供最完整的遺傳資訊分析。人類DNA鑑定技術所產出的相關證據已被廣泛應用於連結嫌犯與刑案之關聯性、失蹤人口協尋及身分辨識等案件。高通量的次世代定序技術不但能在一個檢測中準確分析多重樣品，並能在每個檢體樣品中同時分析多重遺傳標記位點，如表現型單核苷酸多態性 (phenotypic Single nucleotide polymorphism) 、短縱列重複序列（short tandem repeat，STR）等。
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