公務人員面對長官之違法工作指派，應如何處理之相關法條規定於公務員服務法第3條、公務人員保障法第17條：
(一)、公務員服務法第3條及公務人員保障法第17條規定，內容均為一致，只因兩法之適用人員與準用人員不同，使立法者於兩法中分別訂定之：公務人員對於長官監督範圍內之命令，負有服從義務。如認該命令違法，即負有報告之義務，此時該管長官如認該命令未違法，而以書面署名下達時，公務員即應服從，就此所生之責任由該長官負之；令命令違背刑事法律者，公務人員無服從之義務。長官未以書面署名下達時，公務員可請求為之， 長官不為者視為撤回其命令。
(二)、綜上，公務人員如受長官違法之職務指派，依公務員服務法第3條及公務人員保障法第17條規定判斷是否服從。
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